Toutes les sections scientifiques de L'Union sont très actives en Afrique : Tuberculose et VIH, Santé respiratoire et maladies non transmissibles, lutte anti-tabac et Recherche.

Le Bureau RD du Congo de L'Union à Kinshasa soutient la lutte contre la tuberculose et la co-infection tuberculose-VIH menée en République démocratique du Congo ainsi que la collaboration avec le programme national de lutte contre la tuberculose, le ministère de la Santé et autres partenaires du pays.

Le Bureau Ouganda de L'Union : En octobre 2007, L'Union a officiellement ouvert son premier bureau national en Afrique sub-saharienne. Le bureau est installé dans l'immeuble fraîchement rénové du Programme national contre la tuberculose et la lèpre (PNTL).

Le Bureau Zimbabwe de L'Union à Harare coordonne le programme TB CARE et gère d'autres activités de lutte contre la tuberculose et le VIH.